Para realizar el doctorado, se paga anualmente un precio fijo de matrícula en concepto de tutoría. Además de ello, la matrícula comporta pagar una tasa de matriculación que normalmente establece la comunidad autónoma y, en muchos casos, una tasa por determinados servicios docentes como el acceso al campus virtual, por ejemplo, que habitualmente establece la universidad. Al completar los estudios, también hay que pagar una tasa en concepto de expedición del título. Ninguna de estas tasas se incluye en este análisis.
Al finalizar la tesis doctoral, ésta debe defenderse, lo cual comporta el pago de un importe de matrícula por una sola vez.